RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCL11O14625 94 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC14L2O76054 403 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CSPG5O95196 566 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJB2P25686 324 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RFC2P35250 354 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP4BP51164 291 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DIO3P55073 304 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CTBP1Q13363 440 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OXA1LQ15070 435 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6AP1Q15904 470 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC6Q16204 474 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CRIPAKQ8N1N5 446 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BFARQ9NZS9 450 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIOO75962 3097 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD12Q6UB98 2062 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 E2F8A0AVK6 867 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 COQ9O75208 318 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C1SP09871 688 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IMPDH2P12268 514 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP1P13497 986 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CR2P20023 1033 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CD9P21926 228 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT2P50583 147 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH17Q12864 832 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD2Q14681 263 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CTF1Q16619 201 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GEN1Q17RS7 908 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM35AQ86V20 835 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR150Q8NGU9 434 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 JDP2Q8WYK2 163 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF12Q96QT6 1004 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MIS12Q9H081 205 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MIOSQ9NXC5 875 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AREL1O15033 823 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 JRKO75564 520 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCMT1P22061 227 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEA2P43356 314 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTM4Q03013 218 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FLOT2Q14254 428 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX17Q15036 470 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EID2BQ96D98 161 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA33Q96N06 139 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CIB1Q99828 191 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OSBPL11Q9BXB4 747 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT9Q9Y305 439 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IRAK2O43187 625 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TPH1P17752 444 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HLCSP50747 726 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HK3P52790 923 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKN2DP55273 166 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PHC1P78364 1004 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIK2Q13002 908 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM259Q4ZIN3 620 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AGMOQ6ZNB7 445 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HIPK4Q8NE63 616 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ISOC1Q96CN7 298 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF583Q96ND8 569 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A3Q99726 388 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 APBA2Q99767 749 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GLOD4Q9HC38 313 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NCAM2O15394 837 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLIC3O95833 236 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A27O95847 323 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
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