RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHPT1Q8WUD6 406 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHTF18Q8WVB6 975 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP2R3CQ969Q6 453 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 P2RY12Q9H244 342 aa-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 C1RLQ9NZP8 487 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 FLRT3Q9NZU0 649 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PHF11Q9UIL8 331 aa-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PSG11Q9UQ72 335 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFSF13BQ9Y275 285 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 STYXL1Q9Y6J8 313 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 APCP25054 2843 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TRMUO75648 421 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN1O95832 211 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 FTH1P19P0C7X4 201 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMP9P14780 707 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MALP21145 153 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ETV5P41161 510 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 MASP1P48740 699 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR2C2P49116 596 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGTR2P50052 363 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE4AQ14139 1066 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEAD2Q15562 447 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-BQ31612 363 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOGAT2Q3SYC2 334 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SAXO2Q658L1 398 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIGA2Q7L4E1 593 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNK18Q7Z418 384 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMIGO1Q86WK6 493 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC25Q86WR0 208 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF615Q8N8J6 731 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCPH1Q8NEM0 835 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJB14Q8TBM8 379 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC20A1Q8WUM9 679 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLCO2A1Q92959 643 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL22RA2Q969J5 263 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM63Q969Q1 353 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM18Q96B42 140 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALML4Q96GE6 196 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMC6Q96SB8 1091 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 XPR1Q9UBH6 696 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC9A2Q9UBY0 812 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF337Q9Y3M9 751 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTAGE9A4FU28 777 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 LYPD3O95274 346 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 F2P00734 622 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANGP03950 147 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
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