RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 IER5LQ5T953 404 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CROCCP2Q86T23 111 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 MZB1Q8WU39 189 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ACOX2Q99424 681 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 KCNK12Q9HB15 430 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ZFATQ9P243 1243 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HMX2A2RU54 273 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 OR51F1A6NGY5 319 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 A8MX80 341 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ASLP04424 464 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SERPINA4P29622 427 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 NNMTP40261 264 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 MAPK8P45983 427 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ZNF234Q14588 700 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 DEFB123Q8N688 67 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ATP1A2P50993 1020 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PAF1Q8N7H5 531 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 EID2BQ96D98 161 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.23■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 COL4A2P08572 1712 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SOCS5O75159 536 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 LEFTY1O75610 366 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 KRT15P19012 456 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CA4P22748 312 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 GALK1P51570 392 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ST8SIA6P61647 398 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 RASA2Q15283 850 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ARSIQ5FYB1 569 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TRABD2AQ86V40 505 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HDAC10Q969S8 669 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TBATAQ96M53 351 aa20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 NR1D1P20393 614 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 GRIA4P48058 902 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CTBP1Q13363 440 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PACS1Q6VY07 963 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CDKL2Q92772 493 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HLA-CQ95604 372 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PPCSQ9HAB8 311 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA8RI6L899 631 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HNF1BP35680 557 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 IL12RB1P42701 662 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 METAP1P53582 386 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 MROH9Q5TGP6 573 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TMEM245Q9H330 911 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.21■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 A0A0J9YYE9 177 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 TRBC1P01850 177 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 GRIA2P42262 883 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 TFF2Q03403 129 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 STK40Q8N2I9 435 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 SERAC1Q96JX3 654 aa20.2■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms