RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 JCHAINP01591 159 aa18.25■□□□□ 0.51
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PTPRN2-204ENST00000404321 C1QTNF9P0C862 333 aa18.22■□□□□ 0.51
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PTPRN2-204ENST00000404321 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 LHCGRP22888 699 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 CLDN6P56747 220 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
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PTPRN2-204ENST00000404321 KIAA1328Q86T90 577 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 TSPAN33Q86UF1 283 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 LMX1AQ8TE12 382 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 PIH1D2Q8WWB5 315 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 HAUS1Q96CS2 278 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 IFT43Q96FT9 208 aa18.22■□□□□ 0.51
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PTPRN2-204ENST00000404321 EPHB1P54762 984 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 YPEL5P62699 121 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 HS1BP3Q53T59 392 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 FAXCQ5TGI0 409 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 ENPP7Q6UWV6 458 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 MACC1Q6ZN28 852 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 USP45Q70EL2 814 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 RD3Q7Z3Z2 195 aa18.21■□□□□ 0.51
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