RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-204	ENST00000400919	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		27.57	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ZNF292	O60281	2723 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919		A0A1B0GVT2	93 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FGG	P02679	453 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	NFKB1	P19838	968 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	CXCR5	P32302	372 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	GRIK2	Q13002	908 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ARHGEF7	Q14155	803 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	IHH	Q14623	411 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	PBK	Q96KB5	322 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FCRL5	Q96RD9	977 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	MYOC	Q99972	504 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2	9e-11	■□□□□ 10.8
FAAP20-204	ENST00000400919	USP27X	A6NNY8	438 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	C6	P13671	934 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	SDHB	P21912	280 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	VIPR1	P32241	457 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	SEMG2	Q02383	582 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FGL2	Q14314	439 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	NETO1	Q8TDF5	533 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	TADA1	Q96BN2	335 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	IFT43	Q96FT9	208 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	USP29	Q9HBJ7	922 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FZD3	Q9NPG1	666 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		27.55	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919		A0A0J9YYE9	177 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919		A8MX80	341 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	TLR4	O00206	839 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FPGT	O14772	594 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	WNT9A	O14904	365 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	OPHN1	O60890	802 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	PRL	P01236	227 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	TRBC1	P01850	177 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	CDK18	Q07002	472 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	RALGDS	Q12967	914 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	PCSK7	Q16549	785 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LIPI	Q6XZB0	460 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	RMDN1	Q96DB5	314 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	SPATA13	Q96N96	652 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	GBA3	Q9H227	469 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		27.54	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919		A0A1W2PR77	199 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	C5orf60	A6NFR6	353 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LIAS	O43766	372 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	GDF9	O60383	454 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	PMPCB	O75439	489 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	CTPS1	P17812	591 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	PRPSAP1	Q14558	356 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	KIF19	Q2TAC6	998 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LAYN	Q6UX15	382 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		27.53	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919		A6NNZ2	444 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ANXA9	O76027	345 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	CER1	O95813	267 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	HNF1B	P35680	557 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LIMK1	P53667	647 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	GNG11	P61952	73 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	MPP3	Q13368	585 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	LRRC14	Q15048	493 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	AGER	Q15109	404 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	CENPT	Q96BT3	561 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	GDF3	Q9NR23	364 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	UBP1	Q9NZI7	540 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		27.52	■■■□□ 2
FAAP20-204	ENST00000400919	CAPN8	A6NHC0	703 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FAAP20-204	ENST00000400919	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FAAP20-204	ENST00000400919	PSMD11	O00231	422 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FAAP20-204	ENST00000400919	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99

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