RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 DAB2P98082 770 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 INPP5AQ14642 412 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC38Q5VT99 294 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PLD5Q8N7P1 536 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 DTLQ9NZJ0 730 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM149AA5PLN7 773 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF487B1APH4 448 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 K7ESM1 405 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 AQP9O43315 295 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 SPOPO43791 374 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PGLSO95336 258 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK4P11802 303 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNB1P14635 433 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PEX5P50542 639 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ACOX1Q15067 660 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 SPA17Q15506 151 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ODF2Q5BJF6 829 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 FAXCQ5TGI0 409 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 VSIG1Q86XK7 387 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNYQ8ND76 341 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 LMX1AQ8TE12 382 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 FATE1Q969F0 183 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 HDAC11Q96DB2 347 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 APOOQ9BUR5 198 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TFR2Q9UP52 801 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 OR1A2Q9Y585 309 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 LRP4O75096 1905 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 APOL1O14791 398 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 GM2AP17900 193 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ACP1P24666 158 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 NFKBIAP25963 317 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 VIPR1P32241 457 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CLDN6P56747 220 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 DSC2Q02487 901 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PPARDQ03181 441 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ILKQ13418 452 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 MTM1Q13496 603 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 NFATC4Q14934 902 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CNGA3Q16281 694 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 RFX6Q8HWS3 928 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 APOLD1Q96LR9 279 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PANX2Q96RD6 677 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 SPASTQ9UBP0 616 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-DQB2P05538 268 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PDHA1P08559 390 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 MYF5P13349 255 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CTPS1P17812 591 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 HTR1BP28222 390 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf61Q13536 156 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND2CQ68D51 928 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 LGMNQ99538 433 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 AMACRQ9UHK6 382 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 AKAP13Q12802 2813 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 GCATO75600 419 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms