RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 DKK1O94907 266 aa27.37■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 ALG1LQ6GMV1 187 aa27.37■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 SAP25Q8TEE9 199 aa27.37■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 FZD3Q9NPG1 666 aa27.36■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 XRCC4Q13426 336 aa27.35■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF284Q2VY69 593 aa27.35■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC157Q569K6 752 aa27.35■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 SEL1L3Q68CR1 1132 aa27.35■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 ARRDC2Q8TBH0 407 aa27.35■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB7BQ96AH8 199 aa27.35■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 SEPT10Q9P0V9 454 aa27.35■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 C10orf88Q9H8K7 445 aa27.34■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa27.34■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 FTSJ1Q9UET6 329 aa27.34■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC73Q5JTD7 316 aa27.33■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 BRAT1Q6PJG6 821 aa27.33■■□□□ 1.97
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 CAAP1Q9H8G2 361 aa27.33■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 HAUS2Q9NVX0 235 aa27.33■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 GGT7Q9UJ14 662 aa27.33■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 ITM2BQ9Y287 266 aa27.33■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
GNPTAB-202ENST00000392919 H7C0C1 242 aa27.32■■□□□ 1.96
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GNPTAB-202ENST00000392919 CES1P23141 567 aa27.32■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP5OP48047 213 aa27.32■■□□□ 1.96
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF569Q5MCW4 686 aa27.32■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 EID2Q8N6I1 236 aa27.32■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 AGAP3Q96P47 875 aa27.32■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 ENC1O14682 589 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 CAPNS1P04632 268 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 MMP2P08253 660 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-202ENST00000392919 RBL1P28749 1068 aa27.31■■□□□ 1.96
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