RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384580.1

RNU6-1127P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1127, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1127P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GNAQP50148 359 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 COASYQ13057 564 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SNTA1Q13424 505 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 KIF19Q2TAC6 998 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 TXNDC8Q6A555 127 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DSELQ8IZU8 1212 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 BEST2Q8NFU1 509 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SAAL1Q96ER3 474 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 IGSF21Q96ID5 467 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CSF3RQ99062 836 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 KXD1Q9BQD3 176 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 IL25Q9H293 177 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 WDR26Q9H7D7 661 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NOX4Q9NPH5 578 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GJD2Q9UKL4 321 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SARDHQ9UL12 918 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LRRC53A6NM62 1247 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SMTNL1A8MU46 457 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 IFNL4K9M1U5 179 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 WNT9BO14905 357 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CLGNO14967 610 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LDLRAD4O15165 306 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 F9P00740 461 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 AGAP20933 346 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GABRB2P47870 512 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SORDQ00796 357 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DLG1Q12959 904 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 AMZ1Q400G9 498 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SGO1Q5FBB7 561 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 WDR73Q6P4I2 378 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ZBTB2Q8N680 514 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ZNF114Q8NC26 417 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 HUS1BQ8NHY5 278 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SCMH1Q96GD3 660 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C3orf30Q96M34 536 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 TBATAQ96M53 351 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DUX5Q96PT3 197 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GPR108Q9NPR9 543 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SCINQ9Y6U3 715 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 TMEM202A6NGA9 273 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 USP17L23D6RBM5 183 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SOCS6O14544 535 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SLC16A5O15375 505 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SEC14L5O43304 696 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 TNFSF14O43557 240 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NDUFS7O75251 213 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GAGE7O76087 117 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 KDM4BO94953 1096 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CLDN14O95500 239 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CYC1P08574 325 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GAGE12FP0CL80 117 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GAGE12GP0CL81 117 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GAGE12IP0CL82 117 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 G6PDP11413 515 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SHMT1P34896 483 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms