RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 GOT2P00505 430 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 COL6A2P12110 1019 aa24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 CEBPBP17676 345 aa24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 PSMA3P25788 255 aa24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 CRABP2P29373 138 aa24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 HLA-FP30511 346 aa24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 GPATCH11Q8N954 259 aa24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 TM6SF2Q9BZW4 377 aa24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC162PA2VCL2 907 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 C2orf81A6NN90 581 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 GLP2RO95838 553 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 CSNK1DP48730 415 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 OVGP1Q12889 678 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 CES4AQ5XG92 561 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 CEP97Q8IW35 865 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 C10orf82Q8WW14 230 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 IRF7Q92985 503 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 C7orf26Q96N11 449 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 OMDQ99983 421 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 NPHS2Q9NP85 383 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 ACOT9Q9Y305 439 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-201ENST00000380750 S1PR4O95977 384 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CORO7P57737 925 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 TAS2R39P59534 338 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 MBLAC2Q68D91 279 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 MRNIPQ6NTE8 343 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF398Q8TD17 642 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ING5Q8WYH8 240 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 BBS2Q9BXC9 721 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 LINC00597Q9H2U6 94 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 NMRAL1Q9HBL8 299 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 USH1CQ9Y6N9 552 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 SNNO75324 88 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CPA3P15088 417 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 KCNA4P22459 653 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 SLC8A1P32418 973 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 MAPK8P45983 427 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 OCRLQ01968 901 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 STX3Q13277 289 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 OR4L1Q8NH43 312 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 SMIM14Q96QK8 99 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM55Q9BYV6 548 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CERS4Q9HA82 394 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 PIDD1Q9HB75 910 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa24.38■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 APOA4P06727 396 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 LPOP22079 712 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 PGGT1BP53609 377 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 SLC12A2P55011 1212 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 FUT11Q495W5 492 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 C10orf107Q8IVU9 208 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 OTUB2Q96DC9 234 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 TLE6Q9H808 572 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 HACD3Q9P035 362 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 OGNP20774 298 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 PBX2P40425 430 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ABL2P42684 1182 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 GRIA4P48058 902 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF460Q14592 562 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 TNS4Q8IZW8 715 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 NDNQ99608 321 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 GBF1Q92538 1859 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 A0A087X1B8 175 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 PGLSO95336 258 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 IGSF6O95976 241 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 TYRP14679 529 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-201ENST00000380750 EPHB1P54762 984 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms