RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CRHR1P34998 444 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 IRX4P78413 519 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ECT2LQ008S8 904 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 MBLAC2Q68D91 279 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CNSTQ6PJW8 725 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 TTC8Q8TAM2 541 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 VPS11Q9H270 941 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO10Q9UK96 956 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ALPIP09923 528 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ADH5P11766 374 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CCT5P48643 541 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PRAMEP78395 509 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC3Q13217 504 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC1BQ9P126 229 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.42■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SLC7A4O43246 635 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PGLSO95336 258 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 IGSF6O95976 241 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 DHRS4L1P0CG22 281 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 FCARP24071 287 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 BMP8BP34820 402 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CSNK1DP48730 415 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 AP1S1P61966 158 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 IRF9Q00978 393 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SEMG2Q02383 582 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ACVR1Q04771 509 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 BCL2L1Q07817 233 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ADAM15Q13444 863 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA3AQ14563 771 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 MYLK3Q32MK0 819 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CHST14Q8NCH0 376 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 STYXQ8WUJ0 223 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 EID2BQ96D98 161 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 RHOJQ9H4E5 214 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 MTG2Q9H4K7 406 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 EMCNQ9ULC0 261 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ERVW-1Q9UQF0 538 aa15.41■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 A8MX80 341 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 TIMM44O43615 452 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CRTAMO95727 393 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEA12P43365 314 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 EPHB1P54762 984 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF460Q14592 562 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ZSCAN26Q16670 478 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CEP97Q8IW35 865 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 MYADMQ96S97 322 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 GPR22Q99680 433 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 MECRQ9BV79 373 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 GDE1Q9NZC3 331 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf81A6NN90 581 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 TTC34A8MYJ7 566 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 TULP3O75386 442 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 S1PR4O95977 384 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 C2P06681 752 aa15.4■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms