RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PEX11BO96011 259 aa7.71□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 PRKCGP05129 697 aa7.71□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KRT7P08729 469 aa7.71□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ELFN1P0C7U0 828 aa7.71□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CDK4P11802 303 aa7.71□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 JUNDP17535 347 aa7.71□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CKMT2P17540 419 aa7.71□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ACP1P24666 158 aa7.71□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 LIG3P49916 1009 aa7.71□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 KLF15Q9UIH9 416 aa7.71□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NOD2Q9HC29 1040 aa7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NT5MQ9NPB1 228 aa7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.7□□□□□ -1.18
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