RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 MPOP05164 745 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 SERPINA4P29622 427 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 TRIM23P36406 574 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 ARSEP51690 589 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 MMRN1Q13201 1228 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 IHHQ14623 411 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 NFATC4Q14934 902 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 PTPRRQ15256 657 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 NR0B2Q15466 257 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 ISXQ2M1V0 245 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 ERAP2Q6P179 960 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 FAM71BQ8TC56 605 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 MAPK15Q8TD08 544 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 TEKT4Q8WW24 435 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 SPOCK2Q92563 424 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 FGF11Q92914 225 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 ZNF599Q96NL3 588 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 SEPT3Q9UH03 358 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 ATRXP46100 2492 aa15.34■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.33■□□□□ 0.05
CTSW-201ENST00000307886 TMEM202A6NGA9 273 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 USP12O75317 370 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PCCBP05166 539 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ANXA6P08133 673 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 CD48P09326 243 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 AP1S1P61966 158 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 MTM1Q13496 603 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 TCEA2Q15560 299 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 DPPA4Q7L190 304 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 HID1Q8IV36 788 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 OR1E3Q8WZA6 343 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 HIC2Q96JB3 615 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 DEPDC7Q96QD5 511 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 NUP85Q9BW27 656 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 LGR4Q9BXB1 951 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ABCG4Q9H172 646 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 NOD2Q9HC29 1040 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ASCL3Q9NQ33 180 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa15.33■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PMS2P1A4D2B8 440 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 DXOO77932 396 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ARL4AP40617 200 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ABCG1P45844 678 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 LSSP48449 732 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 RENBPP51606 427 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 CFAP58Q5T655 872 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PDXPQ96GD0 296 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 COQ10AQ96MF6 247 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 MGME1Q9BQP7 344 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PRORYQ9H606 182 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 FGF22Q9HCT0 170 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 IFNKQ9P0W0 207 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PADI4Q9UM07 663 aa15.32■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 A0A0U1RQS6 177 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 RASGRP1O95267 797 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 FUCA1P04066 466 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ELFN1P0C7U0 828 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PDX1P52945 283 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 MAXP61244 160 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 TRAF2Q12933 501 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PNCKQ6P2M8 343 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 TEX26Q8N6G2 289 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 WDR92Q96MX6 357 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.31■□□□□ 0.04
CTSW-201ENST00000307886 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms