RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 AASSQ9UDR5 926 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 A0A1B0GVT2 93 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LACTBL1A8MY62 500 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TNFAIP3P21580 790 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ARRB2P32121 409 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PEX5P50542 639 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PMS2P54278 862 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 HNF4GQ14541 408 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 GTF3C6Q969F1 213 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TXNDC15Q96J42 360 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TIGD1Q96MW7 591 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MAF1Q9H063 256 aa4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LDLRAD4O15165 306 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 KLK8O60259 260 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 KCNJ13O60928 360 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 NTN1O95631 604 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CH25HO95992 272 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 RRM1P23921 792 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PCYT1AP49585 367 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CXCR3P49682 368 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ABATP80404 500 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ZBED6P86452 979 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MAMLD1Q13495 774 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PLCB4Q15147 1175 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SARM1Q6SZW1 724 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LCTLQ6UWM7 567 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 DLK2Q6UY11 383 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 GPT2Q8TD30 523 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ASB5Q8WWX0 329 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MIB2Q96AX9 1013 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MTBPQ96DY7 904 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MARK4Q96L34 752 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 WACQ9BTA9 647 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 KRT84Q9NSB2 600 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 A0A0U1RQJ8 604 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 TMEM202A6NGA9 273 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 PAGE4O60829 102 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 ALPLP05186 524 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 KRT10P13645 584 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 ITGAXP20702 1163 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 STX2P32856 288 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 SHMT1P34896 483 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 RXRGP48443 463 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 MXI1P50539 228 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 EFNA5P52803 228 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 LINC00205P59089 165 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 PRAMEP78395 509 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 ARF1P84077 181 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 TFAP4Q01664 338 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 GRIK3Q13003 919 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 TSSK4Q6SA08 328 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 TDRPQ86YL5 185 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 WDR63Q8IWG1 891 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 HACE1Q8IYU2 909 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 ZBTB2Q8N680 514 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.9□□□□□ -1.63
CSN3-201ENST00000304954 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms