RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 PDK4Q16654 411 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PPM1JQ5JR12 505 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 TMEM215Q68D42 235 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 SPOCK2Q92563 424 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 MYO19Q96H55 970 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 FBXO10Q9UK96 956 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 OR51F1A6NGY5 319 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ADH1CP00326 375 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ABL2P42684 1182 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 EPHB1P54762 984 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PTPRRQ15256 657 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 MBLAC2Q68D91 279 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 AHI1Q8N157 1196 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 C2orf81A6NN90 581 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 HAUS5O94927 633 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ARSAP15289 507 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 HADHAP40939 763 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ZSCAN26Q16670 478 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GEN1Q17RS7 908 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ACCSLQ4AC99 568 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CEP44Q9C0F1 390 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 VPS11Q9H270 941 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 REV3LO60673 3130 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 WDR91A4D1P6 747 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 SOCS5O75159 536 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GRIA4P48058 902 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CD151P48509 253 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 DLG2Q15700 870 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 MYLIPQ8WY64 445 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GLRA3O75311 464 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GSRP00390 522 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CISD3P0C7P0 127 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 FCARP24071 287 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 MYLK3Q32MK0 819 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 VOPP1Q96AW1 172 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 EBF3Q9H4W6 596 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 OBP2AQ9NY56 170 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 BNIP3LO60238 219 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 SLC4A1P02730 911 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 MPOP05164 745 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CTPS1P17812 591 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PSMA3P25788 255 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GMPRP36959 345 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 DGKGP49619 791 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CNSTQ6PJW8 725 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 C12orf40Q86WS4 652 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PNPLA1Q8N8W4 532 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 HACD3Q9P035 362 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CDH7Q9ULB5 785 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 A0A096LPK6 155 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 NFATC1O95644 943 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 BMP1P13497 986 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms