RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 HTR3EA5X5Y0 456 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PEX11BO96011 259 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 NADSYN1Q6IA69 706 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 CNSTQ6PJW8 725 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP97Q8IW35 865 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR7D4Q8NG98 312 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 EXOC2Q96KP1 924 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SORT1Q99523 831 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GKN1Q9NS71 199 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCR10P46092 362 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAGLUP54802 743 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS24P62847 133 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 KDELC1Q6UW63 502 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 NXNL1Q96CM4 212 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 NEMP1O14524 444 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPAN3O60637 253 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 STAMBPO95630 424 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSTT2P0CG29 244 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSTT2BP0CG30 244 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 COL6A2P12110 1019 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 TAS2R39P59534 338 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB10P61026 200 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP41Q3LFD5 358 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 IL37Q9NZH6 218 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 XPR1Q9UBH6 696 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCTD3Q9Y597 815 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 G3V2L1 256 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSC2O15499 205 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGEA12P43365 314 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GALNT3Q14435 633 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLC3Q6P597 504 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 LZTS1Q9Y250 596 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM92AA1XBS5 289 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR51F1A6NGY5 319 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PITPNM1O00562 1244 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PGM1P36871 562 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 HADHAP40939 763 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAA20P61599 178 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSHL1Q14406 222 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT72Q14CN4 511 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPDYAQ5MJ70 313 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 HDAC10Q969S8 669 aa21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PSMG1O95456 288 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHRNGP07510 517 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRIA2P42262 883 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 HALP42357 657 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SERINC3Q13530 473 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PGBD5Q8N414 524 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBXO27Q8NI29 283 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 BHMTQ93088 406 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 EBF3Q9H4W6 596 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 VPS45Q9NRW7 570 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PATJQ8NI35 1801 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 LOC100653049A0A140TA62 436 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 MEI4A8MW99 385 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 E9PBE3 544 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLHL41O60662 606 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT34O76011 436 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRIA4P48058 902 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC11A2P49281 568 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTPRCAPQ14761 206 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC2A7Q6PXP3 512 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ISL2Q96A47 359 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM161BQ96MY7 647 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 NDEL1Q9GZM8 345 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 MID2Q9UJV3 735 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 FIS1Q9Y3D6 152 aa21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSPG5O95196 566 aa21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SERPINA6P08185 405 aa21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLD1Q13393 1074 aa21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PARP15Q460N3 678 aa21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 WASHC2DQ5SRD0 308 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms