RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289228.6

ACTR1B-201, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTR1B, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1B-201ENST00000289228 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 VILLO15195 856 aa22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 TRMOQ9BU70 441 aa22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 ALG9Q9H6U8 611 aa22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 AK5Q9Y6K8 562 aa22.7■■□□□ 1.23
ACTR1B-201ENST00000289228 PATJQ8NI35 1801 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 A0A1W2PQH9 124 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 MYADML2A6NDP7 307 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 GPR182O15218 404 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 CDKN2DP55273 166 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 GPR158Q5T848 1215 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 GALNT7Q86SF2 657 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SERPINB11Q96P15 392 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ETAA1Q9NY74 926 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 CROTQ9UKG9 612 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 A0A1B0GVG6 124 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 J3KR12 359 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC7A4O43246 635 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 NRP2O60462 931 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SUPT7LO94864 414 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 TSPAN8P19075 237 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 YWHAQP27348 245 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 NRF1Q16656 503 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 MARC1Q5VT66 337 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 LAYNQ6UX15 382 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 VPS45Q9NRW7 570 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 FNIP2Q9P278 1114 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 CD300AQ9UGN4 299 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 PTPRDP23468 1912 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 CCL22O00626 93 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 CSPG5O95196 566 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 MT-CO1P00395 513 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 DSC2Q02487 901 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 USP41Q3LFD5 358 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 FAM219BQ5XKK7 198 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 FAM45BPQ6NSW5 357 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 FAM45AQ8TCE6 357 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 HDAC10Q969S8 669 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 HMCESQ96FZ2 354 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 MPP4Q96JB8 637 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 C1orf74Q96LT6 269 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 PTTG2Q9NZH5 202 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 CCDC160A6NGH7 325 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 H0YJX3 145 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 TRPA1O75762 1119 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 S1PR4O95977 384 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 PSMC3P17980 439 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 KCNC1P48547 511 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 PRAMEP78395 509 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 RIN3Q8TB24 985 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 DDI1Q8WTU0 396 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ATP6AP2O75787 350 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ITGB1P05556 798 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 MMP2P08253 660 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ATP4BP51164 291 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ARSDP51689 593 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 NDST2P52849 883 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 APOFQ13790 326 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 CYP2R1Q6VVX0 501 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ISCA2Q86U28 154 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF597Q96LX8 424 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTR1B-201ENST00000289228 HACD3Q9P035 362 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms