RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 NR2C2P49116 596 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC13A2Q13183 592 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RIN1Q13671 783 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RFX4Q33E94 735 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 NEPROQ6NW34 567 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 LMAN2LQ9H0V9 348 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC72A6NJI9 287 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MUI8 341 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GP5P40197 560 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GANQ9H2C0 597 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GW55 424 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SEPHS1P49903 392 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF132P52740 706 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CEBPGP53567 150 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CCNJLQ8IV13 435 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DUX4Q9UBX2 424 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MYBL2P10244 700 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 OAZ1P54368 228 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ENPP7Q6UWV6 458 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 BEND5Q7L4P6 421 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 LZTR1Q8N653 840 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RARAP10276 462 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FASP25445 335 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 IL12BP29460 328 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 NRIP1P48552 1158 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 HNMTP50135 292 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP3CAQ08209 521 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CRHR2Q13324 411 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 XKR4Q5GH76 650 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MLIPQ5VWP3 458 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF276Q8N554 614 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CDRT15Q96T59 188 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RIPK3Q9Y572 518 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BMM5 538 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 AHCYP23526 432 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TTI2Q6NXR4 508 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FNDC11Q9BVV2 318 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GLTPD2A6NH11 291 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CCL5P13501 91 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TFEBP19484 476 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 NEK3P51956 506 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM9CQ8IZT9 166 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 QRFPRQ96P65 431 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 REEP1Q9H902 201 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RRN3Q9NYV6 651 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS4AQ9UN37 437 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 OR1F1O43749 312 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FUT4P22083 530 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNA5P22460 613 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 OR10H5Q8NGA6 315 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 STK39Q9UEW8 545 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.9□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 IL6P05231 212 aa11.9□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ALPPL2P10696 532 aa11.9□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC153Q494R4 210 aa11.9□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SUN3Q8TAQ9 357 aa11.9□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ART5Q96L15 291 aa11.9□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.9□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.9□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms