RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FEM1CQ96JP0 617 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NELL2Q99435 816 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIFC1Q9BW19 673 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INSIG1O15503 277 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INHBAP08476 426 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALADP13716 330 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NTSR1P30989 418 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAB1Q13506 487 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ENPP2Q13822 863 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PI15O43692 258 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIN3BO75182 1162 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIAS1O75925 651 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPOP01588 193 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHRNA4P43681 627 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP1A2P50993 1020 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC32Q14392 662 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC1A5Q15758 541 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRABD2AQ86V40 505 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM1BQ8NB78 822 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHST14Q8NCH0 376 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDKL2Q92772 493 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFT43Q96FT9 208 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CERS2Q96G23 380 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP44Q9C0F1 390 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SENP1Q9P0U3 644 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM221A6NGB7 291 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 M0R296 226 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT15P19012 456 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HLA-DPA1P20036 260 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL9A1P20849 921 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCNN1BP51168 640 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDK18Q07002 472 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MGAT5Q09328 741 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CES3Q6UWW8 571 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RANBP9Q96S59 729 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOD2Q9HC29 1040 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADRA1DP25100 572 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POU6F1Q14863 301 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARD16Q5EG05 197 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SDE2Q6IQ49 451 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK40Q8N2I9 435 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GABRG3Q99928 467 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPC1O15118 1278 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FGF1P05230 155 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXB2P14652 356 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms