RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAB23Q9ULC3 237 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TBC1D3BA6NDS4 549 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 F8VP50 259 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ITGA2BP08514 1039 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ALOX12P18054 663 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IL12AP29459 219 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CDK18Q07002 472 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PPP3CAQ08209 521 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZNF846Q147U1 533 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RPTNQ6XPR3 784 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MON1AQ86VX9 555 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TMC8Q8IU68 726 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DENND1CQ8IV53 801 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PDPRQ8NCN5 879 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GAD1Q99259 594 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 COG5Q9UP83 839 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCDC182A6NF36 153 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A2O15244 555 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IFNA16P05015 189 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 APODP05090 189 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 WEE1P30291 646 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MTAPQ13126 283 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TSC22D1Q15714 1073 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NEDD8Q15843 81 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DUPD1Q68J44 220 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BEND5Q7L4P6 421 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 A0A087X0B3 334 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MAP2K7O14733 419 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ALOX15BO15296 676 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HDAC3O15379 428 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 B4GALT4O60513 344 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NR2F1P10589 423 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CRHR1P34998 444 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ARFIP1P53367 373 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAB2AP61019 212 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PFKPQ01813 784 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SPIBQ01892 262 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LIN54Q6MZP7 749 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PPCDCQ96CD2 204 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 VPS35Q96QK1 796 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NUAK2Q9H093 628 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PIF1Q9H611 641 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EHD3Q9NZN3 535 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NFAT5O94916 1531 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SYN3O14994 580 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RGS20O76081 388 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FGBP02675 491 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PROCP04070 461 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM153BP0C7A2 387 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PRKAR1AP10644 381 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RCVRNP35243 200 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CDH8P55286 799 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 QPRTQ15274 297 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM153CQ494X1 144 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TTMPQ5BVD1 217 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GPR180Q86V85 440 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB2Q8N680 514 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AKT1S1Q96B36 256 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CLCC1Q96S66 551 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ING3Q9NXR8 418 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NID2Q14112 1375 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms