RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MKLN1Q9UL63 735 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SVILO95425 2214 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 C19orf81C9J6K1 198 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NRP2O60462 931 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 AVILO75366 819 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 LRATO95237 230 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PHC1P78364 1004 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SLC34A3Q8N130 599 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 H3BNH8 94 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ACTR3P61158 418 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RAB26Q9ULW5 256 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TSPAN3O60637 253 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 HNF4AP41235 474 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 GJD3Q8N144 294 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SCN2AQ99250 2005 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 WFS1O76024 890 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 URODP06132 367 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 THP07101 528 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZNF12P17014 697 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 HUNKP57058 714 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CYP4X1Q8N118 509 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PGM2Q96G03 612 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MUC13Q9H3R2 512 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 GIN1Q9NXP7 522 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SLC30A4O14863 429 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ECHS1P30084 290 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ING5Q8WYH8 240 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MYO7AQ13402 2215 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SIN3BO75182 1162 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 GSTT2BP0CG30 244 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 LIPMQ5VYY2 423 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ABRAQ8N0Z2 381 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 FAM47BQ8NA70 645 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TTPAP49638 278 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MCOLN2Q8IZK6 566 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PSKH1P11801 424 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 INSCQ1MX18 579 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZNF398Q8TD17 642 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 BSNDQ8WZ55 320 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RTKNQ9BST9 563 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RPTORQ8N122 1335 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 HMGCRP04035 888 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 EDEM1Q92611 657 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 UNC13BO14795 1591 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MID1O15344 667 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 HOXA2O43364 376 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZNF280DQ6N043 979 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 AMIGO2Q86SJ2 522 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RFKQ969G6 155 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SEMA3GQ9NS98 782 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZNF521Q96K83 1311 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 GPR182O15218 404 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 DNASE1L1P49184 302 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms