RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc8bQ5DU41 803 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mgat5bQ765H6 792 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tigd3Q7TM95 470 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zdhhc17Q80TN5 632 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DseQ8BLI4 958 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nuak2Q8BZN4 639 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam204aQ8C6C7 236 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stard13Q923Q2 1113 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tlr6Q9EPW9 795 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gfra4Q9JJT2 260 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Iigp1Q9QZ85 413 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tubd1Q9R1K7 455 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CitP49025 2055 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc120A2AEV7 629 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r120E9PX34 856 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r14E9Q759 848 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spaca6E9Q8Q8 339 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbtb10E9Q8X5 861 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2210016F16RikG3X8U3 338 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp607bG3X9H3 648 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pim1P06803 397 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd72P21855 354 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpc4P51655 557 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tgtp2Q3T9E4 415 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tgtp1Q62293 415 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc25a23Q6GQS1 467 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nudt16Q6P3D0 195 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gucy2gQ6TL19 1100 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msantd1Q8BIL2 278 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pggt1bQ8BUY9 377 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cacnb2Q8CC27 655 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AcmsdQ8R519 336 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zmat2Q9CPW7 199 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nectin1Q9JKF6 515 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CpqQ9WVJ3 470 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm29106A0A087WSP8 697 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klhl18A0A0G2JGN5 579 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdr2lA2A6T1 465 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arl4aP61213 200 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AcdQ5EE38 416 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galnt2Q6PB93 570 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rslcan18Q7M6X5 460 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr141Q7TQP0 305 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Amigo2Q80ZD9 519 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Frs2Q8C180 508 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Parp9Q8CAS9 866 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tada2aQ8CHV6 443 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abhd11Q8K4F5 307 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dclre1cQ8K4J0 705 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim31Q8R0K2 507 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GOLGA7BQ9D428 167 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnfsf13Q9D777 241 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sapcd2Q9D818 391 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P2yr13Q9D8I2 337 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hipk3Q9ERH7 1192 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ngly1Q9JI78 651 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gon4lQ9DB00 2260 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TriqkB2B9E1 86 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10722F6VLK5 217 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr731F8VQB9 326 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6408J3QNG1 320 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3402K7N5P2 326 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clk2O35491 499 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MafP54843 370 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab10P61027 200 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chsy3Q5DTK1 884 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nr1d2Q60674 576 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mysm1Q69Z66 819 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prrt3Q6PE13 971 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pik3c3Q6PF93 887 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il17reQ8BH06 637 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plekhg6Q8R0J1 787 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbms2Q8VC70 383 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdhga4Q91XY4 930 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Art4Q9CRA0 300 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpap3Q9D706 660 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PirQ9D711 290 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AgkQ9ESW4 421 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trbv4A0A075B5I2 113 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm11549A0A286YD83 63 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r3A2AMT7 306 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr50O88495 591 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajb5O89114 348 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cst8P32766 142 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndst2P52850 883 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acot8P58137 320 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.7 ms