RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 RBP1P09455 135 aa9.9□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 CYP11B1P15538 503 aa9.9□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 GPR15P49685 360 aa9.9□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.9□□□□□ -0.83
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SPTAN1-228ENST00000635853 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
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SPTAN1-228ENST00000635853 SNTG2Q9NY99 539 aa9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 H3BN98 237 aa9.89□□□□□ -0.83
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SPTAN1-228ENST00000635853 PRODHO43272 600 aa9.89□□□□□ -0.83
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SPTAN1-228ENST00000635853 MAP3K6O95382 1288 aa9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SEPHS1P49903 392 aa9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PDX1P52945 283 aa9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 CCNIQ14094 377 aa9.89□□□□□ -0.83
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