RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617185.4

TP53-222, Transcript of tumor protein p53, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TP53, Length 2,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53-222	ENST00000617185	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	LCT	P09848	1927 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	PMM2	O15305	246 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ABCB7	O75027	752 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CAPG	P40121	348 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	STAT5B	P51692	787 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	B2M	P61769	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CITED4	Q96RK1	184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	C8orf4	Q9NR00	106 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	POLH	Q9Y253	713 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	HMX2	A2RU54	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	TAF5	Q15542	800 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	DGUOK	Q16854	277 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CADM2	Q8N3J6	435 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	POC5	Q8NA72	575 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	DACH2	Q96NX9	599 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	UPK1B	O75841	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CSH1	P0DML2	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CSH2	P0DML3	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	IMPDH1	P20839	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CDKN2B	P42772	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CAPS	Q13938	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	STK11	Q15831	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	AGAP6	Q5VW22	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	AGAP4	Q96P64	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	MCM3AP	O60318	1980 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185		A0A1W2PQ72	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	HSPA4L	O95757	839 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	PTTG1	O95997	202 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	CNTF	P26441	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	GSTM2	P28161	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	SLC9A3	P48764	834 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	DSTN	P60981	165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	PSME3	P61289	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	BNIP2	Q12982	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	ERAP2	Q6P179	960 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TP53-222	ENST00000617185	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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