RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616894.1

ATRNL1-210, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATRNL1, Length 1,701 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-210ENST00000616894 IHHQ14623 411 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 PEX26Q7Z412 305 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 MFSD2AQ8NA29 543 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 AMFRQ9UKV5 643 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1-210ENST00000616894 TLR4O00206 839 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 TGM2P21980 687 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM193AP78312 1265 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SGCGQ13326 291 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 PPP2R5EQ16537 467 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 AADACL2Q6P093 401 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 GCNT7Q6ZNI0 430 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SKA1Q96BD8 255 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 COQ6Q9Y2Z9 468 aa23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SOCS5O75159 536 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 MMP12P39900 470 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 NR2C2P49116 596 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SUOXP51687 545 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 RWDD2BP57060 319 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM52BQ4KMG9 183 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 RALGPS1Q5JS13 557 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ALG1LQ6GMV1 187 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ERAP2Q6P179 960 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 IL12RB2Q99665 862 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SPTBN2O15020 2390 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 A8MX80 341 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 NXPH1P58417 271 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 NIPAL4Q0D2K0 466 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 KDM7AQ6ZMT4 941 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 CNTD1Q8N815 330 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 P3H4Q92791 437 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 AMACRQ9UHK6 382 aa23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 POM121BA6NF01 834 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 KRT86O43790 486 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 TM7SF2O76062 418 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 PYGMP11217 842 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 CD59P13987 128 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 KCNA4P22459 653 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 COPS2P61201 443 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 IL9RQ01113 521 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 OR13H1Q8NG92 308 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 KLHDC7BQ96G42 594 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 BMFQ96LC9 184 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 TM7SF3Q9NS93 570 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 RAI2Q9Y5P3 530 aa23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SPEGQ15772 3267 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 CPP00450 1065 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 CCDC175P0C221 793 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 THEGLP0DJG4 465 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 C6P13671 934 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 LIG3P49916 1009 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 RALGDSQ12967 914 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 BBS12Q6ZW61 710 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 IQCHQ86VS3 1027 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 GDF3Q9NR23 364 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 CACNA1AO00555 2505 aa23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 PGLSO95336 258 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 PDHA1P08559 390 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 PTPRRQ15256 657 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ARMC12Q5T9G4 340 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 AGAP3Q96P47 875 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 OVGP1Q12889 678 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 DEFB124Q8NES8 71 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ASB12Q8WXK4 309 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 SPOCK2Q92563 424 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 CENPTQ96BT3 561 aa23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1-210ENST00000616894 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms