RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	GGA2	Q9UJY4	613 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	CDH7	Q9ULB5	785 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PVT1-222	ENST00000613916	FRY	Q5TBA9	3013 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	F5	P12259	2224 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MAGEB16	A2A368	324 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MROH6	A6NGR9	719 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	AP3B1	O00203	1094 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FZD6	O60353	706 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FAM155B	O75949	473 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NDST3	O95803	873 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	POLB	P06746	335 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PDHA1	P08559	390 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SP9	P0CG40	484 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SRC	P12931	536 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CES1	P23141	567 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ADRA1D	P25100	572 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ARNT	P27540	789 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	STX2	P32856	288 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CSNK1D	P48730	415 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CDK18	Q07002	472 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC20A2	Q08357	652 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MESP2	Q0VG99	397 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TRAF2	Q12933	501 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DMC1	Q14565	340 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	POU6F1	Q14863	301 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GEN1	Q17RS7	908 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PCID2	Q5JVF3	399 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CASC4	Q6P4E1	433 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SRL	Q86TD4	932 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TRABD2A	Q86V40	505 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NAT16	Q8N8M0	369 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TTC17	Q96AE7	1141 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MFSD3	Q96ES6	412 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MYO19	Q96H55	970 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RANBP9	Q96S59	729 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CYTH2	Q99418	400 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	EBF3	Q9H4W6	596 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TREX1	Q9NSU2	369 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	WNT16	Q9UBV4	365 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TBK1	Q9UHD2	729 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CHKB	Q9Y259	395 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SPTBN2	O15020	2390 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916		A0A1W2PPM1	405 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC78	A2IDD5	438 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	HMX2	A2RU54	273 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	LDB2	O43679	373 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TULP3	O75386	442 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PRKCG	P05129	697 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FGF1	P05230	155 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ERVK-10	P10266	1014 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ADH5	P11766	374 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	LAMP2	P13473	410 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	HLA-DPA1	P20036	260 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NR1D1	P20393	614 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MSH2	P43246	934 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC6A11	P48066	632 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RHOA	P61586	193 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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