RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 CSRP3P50461 194 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 WNT3AP56704 352 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJB13P59910 316 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SATB1Q01826 763 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 DSG1Q02413 1049 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TNK2Q07912 1038 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MAPRE2Q15555 327 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNA10Q16322 511 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMD5Q16401 504 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PARP15Q460N3 678 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF280DQ6N043 979 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NEPROQ6NW34 567 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TMC7Q7Z402 723 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MAVSQ7Z434 540 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 BBS5Q8N3I7 341 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX13Q92968 403 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 AZIN2Q96A70 460 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TREX1Q9NSU2 369 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 XPR1Q9UBH6 696 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPRDP23468 1912 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PLXNA3P51805 1871 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 E2F8A0AVK6 867 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 E9PBE3 544 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MATN2O00339 956 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF195O14628 629 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC7A4O43246 635 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL41O60662 606 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TBX10O75333 385 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 PIGNO95427 931 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC1A2P43004 574 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 NUMBP49757 651 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FLT3LGP49771 235 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXK2Q01167 660 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 BTKQ06187 659 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 DSC1Q08554 894 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 KLF10Q13118 480 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGA7Q13683 1181 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 DLG2Q15700 870 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC14A2Q15849 920 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MARC1Q5VT66 337 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 KDELC1Q6UW63 502 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SCD5Q86SK9 330 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ABI1Q8IZP0 508 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms