RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583649.1

CASC3-208, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, human

TSL 3

Gene CASC3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC3-208	ENST00000583649	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	PGD	P52209	483 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	GPLD1	P80108	840 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	MAP7	Q14244	749 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	ALF	Q53S48	1182 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	ANKS6	Q68DC2	871 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	OR1A2	Q9Y585	309 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CASC3-208	ENST00000583649	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	DRGX	A6NNA5	263 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	STK17B	O94768	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	PCCB	P05166	539 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	THRA	P10827	490 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	KRT5	P13647	590 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	COL8A1	P27658	744 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	CD1C	P29017	333 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	IRAK1	P51617	712 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ARSD	P51689	593 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	PMS2	P54278	862 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	GNA12	Q03113	381 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	GRM3	Q14832	879 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	NR1D2	Q14995	579 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	UBR7	Q8N806	425 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	PDXP	Q96GD0	296 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	IGSF6	O95976	241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	NR1D1	P20393	614 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	GGCX	P38435	758 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	KIAA1024L	P59773	190 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ARF5	P84085	180 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	MC2R	Q01718	297 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	GCNT1	Q02742	428 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	CUL4A	Q13619	759 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	MPP6	Q9NZW5	540 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	TLK1	Q9UKI8	766 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	THAP12	O43422	761 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	CLDN1	O95832	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	RECK	O95980	971 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CASC3-208	ENST00000583649	CCNB1	P14635	433 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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