RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	GSTA2	P09210	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CHN1	P15882	459 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	DRD4	P21917	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CTSS	P25774	331 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	HSD3B2	P26439	372 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	AXL	P30530	894 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC8A1	P32418	973 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	STX2	P32856	288 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRB2	P47870	512 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNJ1	P48048	391 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SEC24C	P53992	1094 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	LGALS4	P56470	323 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MYL6	P60660	151 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX1	Q13596	522 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	DHCR24	Q15392	516 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TAZ	Q16635	292 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KYNU	Q16719	465 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ARC	Q7LC44	396 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	USP7	Q93009	1102 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PCYT2	Q99447	389 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MCF2L	O15068	1137 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CHUK	O15111	745 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TM9SF1	O15321	606 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66	2e-6	■□□□□ 9
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM189A1	O60320	539 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZWINT	O95229	277 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CD4	P01730	458 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	APOC2	P02655	101 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SHBG	P04278	402 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	LPL	P06858	475 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	HKR1	P10072	659 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CETP	P11597	493 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	BRAF	P15056	766 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CD19	P15391	556 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	BPI	P17213	487 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PAX3	P23760	479 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KDELR1	P24390	212 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMA2	P25787	234 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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