RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF366Q8N895 744 aa23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 ECHDC3Q96DC8 303 aa23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 FETUBQ9UGM5 382 aa23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 HCN2Q9UL51 889 aa23.53■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 MROH6A6NGR9 719 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRKCGP05129 697 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYZAPP0CAP1 466 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL9P15248 144 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLCO1A2P46721 670 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRIA4P48058 902 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 EPHB1P54762 984 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEPT6Q14141 434 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 MED4Q9NPJ6 270 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIAS3Q9Y6X2 628 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 TLDC2A0PJX2 215 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 LDB2O43679 373 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIAS1O75925 651 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIRTP0C851 137 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNFRSF4P43489 277 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 LAMB3Q13751 1172 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRIG1Q96JA1 1093 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPCSQ9HAB8 311 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 TREX1Q9NSU2 369 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 VPS18Q9P253 973 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 WASF2Q9Y6W5 498 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYLKQ15746 1914 aa23.52■■□□□ 1.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 COL4A2P08572 1712 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC78A2IDD5 438 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANTXRLA6NF34 631 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSP90B2PQ58FF3 399 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPOCK2Q92563 424 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 CERS2Q96G23 380 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL36AQ9UHA7 158 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 F5P12259 2224 aa23.51■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM159BA6NKW6 160 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMIM23A6NLE4 172 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 K7EQS6 105 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 UGT2B4P06133 528 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 BMP1P13497 986 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 HLA-EP13747 358 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 GCAP28676 217 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL12RB1P42701 662 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 PFKPQ01813 784 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 C9orf64Q5T6V5 341 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSTD2Q5T7W7 516 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 EMC10Q5UCC4 262 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 GDPD4Q6W3E5 623 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAF1Q8N7H5 531 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 PEX13Q92968 403 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMIM14Q96QK8 99 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMYD2Q9NRG4 433 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1W2PQ67 120 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 NARSO43776 548 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDH16O75309 829 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 LEFTY1O75610 366 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRTAMO95727 393 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTSLP07711 333 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 TDGQ13569 410 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 E2F5Q15329 346 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNGA3Q16281 694 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARSIQ5FYB1 569 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSWIM9Q86XI8 627 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 MDGA1Q8NFP4 955 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACOX2Q99424 681 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGEE1Q9HCI5 957 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa23.5■■□□□ 1.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC24A2Q9UI40 661 aa23.5■■□□□ 1.35
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