RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580419.5

SMARCE1-216, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 1,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMARCE1-216ENST00000580419 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 AMACRQ9UHK6 382 aa14.59□□□□□ -0.07
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SMARCE1-216ENST00000580419 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ATMQ13315 3056 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCE1-216ENST00000580419 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCE1-216ENST00000580419 PSMD11O00231 422 aa14.58□□□□□ -0.08
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SMARCE1-216ENST00000580419 PIGNO95427 931 aa14.58□□□□□ -0.08
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