RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577886.5

TRIM16-211, Transcript of tripartite motif containing 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM16, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16-211ENST00000577886 NT5MQ9NPB1 228 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 STOML1Q9UBI4 398 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 MYLKQ15746 1914 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SLC12A8A0AV02 714 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 J3KR12 359 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TK2O00142 265 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 CIB2O75838 187 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 CNTN5O94779 1100 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 IMPDH2P12268 514 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SAT1P21673 171 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PRDX6P30041 224 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 CTNNB1P35222 781 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 CD86P42081 329 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 CHRNA4P43681 627 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 COPAP53621 1224 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SLC12A2P55011 1212 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 MXRA7P84157 204 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ITKQ08881 620 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 LAMB3Q13751 1172 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PCSK7Q16549 785 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 FUT10Q6P4F1 479 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PSMG2Q969U7 264 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TADA1Q96BN2 335 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 COG4Q9H9E3 785 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 MARCH5Q9NX47 278 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 COL4A6Q14031 1691 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TARM1B6A8C7 271 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TBC1D4O60343 1298 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TBX18O95935 607 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 LINC00271P0C7V0 271 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 GRIA4P48058 902 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SLC11A1P49279 550 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 CLCN5P51795 746 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ARPP19P56211 112 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PRKAA1Q13131 559 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 GPM6BQ13491 265 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 SERINC3Q13530 473 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 GPR152Q8TDT2 470 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 PEX13Q92968 403 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 IGSF8Q969P0 613 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 ZNF599Q96NL3 588 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 TSC22D3Q99576 134 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIM16-211ENST00000577886 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms