RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACTN2P35609 894 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GJC1P36383 396 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMP12P39900 470 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF165P49910 485 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LIG3P49916 1009 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 AIF1P55008 147 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPARDQ03181 441 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTK2BQ14289 1009 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC14Q15048 493 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR0B2Q15466 257 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 UGP2Q16851 508 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALG11Q2TAA5 492 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERMARDQ5T6L9 678 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DENND2CQ68D51 928 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERAP2Q6P179 960 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MACC1Q6ZN28 852 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRLQ86TD4 932 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 KYQ8NBH2 561 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASB12Q8WXK4 309 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPH1Q92598 858 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLPBQ9H078 707 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC19Q9H756 370 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DKK3Q9UBP4 350 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLQ9UEF7 1012 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRP4O75096 1905 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GTH6 734 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPAN11A1L157 253 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMTNL1A8MU46 457 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LMO7DNF2Z398 122 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 YY2O15391 372 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASGRP1O95267 797 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINC1P01008 464 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GP1BAP07359 652 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ELFN1P0C7U0 828 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTSEP14091 401 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMPD1P23109 780 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL1R2P27930 398 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINA4P29622 427 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 HTR7P34969 479 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARL4AP40617 200 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCNN1BP51168 640 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDST2P52849 883 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXADRP78310 365 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL2L1Q07817 233 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF235Q14590 738 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 INPP5AQ14642 412 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFATC4Q14934 902 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACAP1Q15027 740 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISXQ2M1V0 245 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LUZP1Q86V48 1076 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGF11Q92914 225 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTBD6Q96KE9 485 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOOQ9BUR5 198 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 BOCQ9BWV1 1114 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP29Q9HBJ7 922 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms