RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 BRINP1O60477 761 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 GCATO75600 419 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ANXA6P08133 673 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 AMPD1P23109 780 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 PCK1P35558 622 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 SCNN1BP51168 640 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 DPYSQ14117 519 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ACAP1Q15027 740 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 WSCD2Q2TBF2 565 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ZSWIM9Q86XI8 627 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 LZTR1Q8N653 840 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 GLMNQ92990 594 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 CACNA1GO43497 2377 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 PCCBP05166 539 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 CTSEP14091 401 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TCF4P15884 667 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 IL1R2P27930 398 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 MMP12P39900 470 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ABCG1P45844 678 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 RENBPP51606 427 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 INPP5AQ14642 412 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 NR0B2Q15466 257 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 NFKBIBQ15653 356 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 BOLA3Q53S33 107 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 HGSNATQ68CP4 663 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 GUSBP11Q6P575 273 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 HID1Q8IV36 788 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 APOOQ9BUR5 198 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC61Q9BV99 259 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 SEPT3Q9UH03 358 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PQJ5 194 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 CSO75390 466 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 SERPING1P05155 500 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TSHRP16473 764 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 HTR1BP28222 390 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 RPIAP49247 311 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 PEX5P50542 639 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 BLKP51451 505 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF235Q14590 738 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TCEA2Q15560 299 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 DPYSL2Q16555 572 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 BTBD6Q96KE9 485 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 THAP2Q9H0W7 228 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 OR1A2Q9Y585 309 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 A8MX80 341 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 LMO7DNF2Z398 122 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 MUSKO15146 869 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 RRP8O43159 456 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 RARAP10276 462 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ACTN2P35609 894 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 PBX1P40424 430 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ZBED6P86452 979 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ITPR1Q14643 2758 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 NFATC4Q14934 902 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 CRELD1Q96HD1 420 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 TBATAQ96M53 351 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 NUP85Q9BW27 656 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 BOCQ9BWV1 1114 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 CLPBQ9H078 707 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP4C-211ENST00000567642 YY2O15391 372 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 USP12O75317 370 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 RASGRP1O95267 797 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ELFN1P0C7U0 828 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 TGM2P21980 687 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP4C-211ENST00000567642 ITPKBP27987 946 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms