RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 FZD2Q14332 565 aa30.95■■■□□ 2.55
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CMTM4-204ENST00000563952 ODF2Q5BJF6 829 aa30.95■■■□□ 2.55
CMTM4-204ENST00000563952 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CMTM4-204ENST00000563952 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa30.95■■■□□ 2.55
CMTM4-204ENST00000563952 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CMTM4-204ENST00000563952 TFR2Q9UP52 801 aa30.95■■■□□ 2.55
CMTM4-204ENST00000563952 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
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CMTM4-204ENST00000563952 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa30.94■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 IRF4Q15306 451 aa30.94■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 TPRG1LQ5T0D9 272 aa30.94■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 RHOT1Q8IXI2 618 aa30.94■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 UCKL1Q9NWZ5 548 aa30.94■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 A8MX80 341 aa30.93■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 DGKAP23743 735 aa30.93■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC38Q5VT99 294 aa30.93■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 PARGQ86W56 976 aa30.93■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 TEX26Q8N6G2 289 aa30.93■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 IFT43Q96FT9 208 aa30.93■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 MATN3O15232 486 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 SOCS5O75159 536 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 CPP00450 1065 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 MX2P20592 715 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 CCNCP24863 283 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 THOP1P52888 689 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 TRAF2Q12933 501 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 RALGDSQ12967 914 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC14Q15048 493 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 SLC25A45Q8N413 288 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 CCNYQ8ND76 341 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 TSGA13Q96PP4 275 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 SEMA3CQ99985 751 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 DTLQ9NZJ0 730 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 TTLL3Q9Y4R7 772 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa30.92■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 FFAR2O15552 330 aa30.91■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 NEBLO76041 1014 aa30.91■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 DNAJC3Q13217 504 aa30.91■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 WSCD2Q2TBF2 565 aa30.91■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 MAML1Q92585 1016 aa30.91■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 GOLPH3Q9H4A6 298 aa30.91■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF487B1APH4 448 aa30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 APOL1O14791 398 aa30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 ELFN1P0C7U0 828 aa30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 PTK2BQ14289 1009 aa30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 RFX6Q8HWS3 928 aa30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 TMTC1Q8IUR5 882 aa30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 PLD5Q8N7P1 536 aa30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 B4GALT6Q9UBX8 382 aa30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 A0A1W2PQ67 120 aa30.89■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 H3BM21 787 aa30.89■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 NDUFA10O95299 355 aa30.89■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP30.89■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 YPEL5P62699 121 aa30.89■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 SLC9A4Q6AI14 798 aa30.89■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 VSIG1Q86XK7 387 aa30.89■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC13Q8IYE1 715 aa30.89■■■□□ 2.54
CMTM4-204ENST00000563952 HDAC11Q96DB2 347 aa30.89■■■□□ 2.54
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CMTM4-204ENST00000563952 PCCBP05166 539 aa30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 NME1P15531 152 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 DSC2Q02487 901 aa30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 HS1BP3Q53T59 392 aa30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 FATE1Q969F0 183 aa30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 LGMNQ99538 433 aa30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 HAUS2Q9NVX0 235 aa30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 KLF15Q9UIH9 416 aa30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 MSRB2Q9Y3D2 182 aa30.88■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 RAI2Q9Y5P3 530 aa30.88■■■□□ 2.53
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