RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	OVGP1	Q12889	678 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SHB	Q15464	509 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF284	Q2VY69	593 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CFAP58	Q5T655	872 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	BBS12	Q6ZW61	710 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TTC7B	Q86TV6	843 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	HORMAD1	Q86X24	394 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	KRT35	Q92764	455 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	EXOC2	Q96KP1	924 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	MYOC	Q99972	504 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1B0GTQ1	180 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CFAP69	A5D8W1	941 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	MUSK	O15146	869 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	INSIG1	O15503	277 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	MAGEC1	O60732	1142 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	NEBL	O76041	1014 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	APOC2	P02655	101 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ABL2	P42684	1182 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	RGR	P47804	291 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	NXPH1	P58417	271 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	XRCC4	Q13426	336 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	STAT4	Q14765	748 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	UGP2	Q16851	508 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	IQCH	Q86VS3	1027 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	PGBD5	Q8N414	524 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CCNY	Q8ND76	341 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	P3H4	Q92791	437 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	IL12RB2	Q99665	862 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	FZD3	Q9NPG1	666 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	HACD1	B0YJ81	288 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	FLRT2	O43155	660 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHGA12	O60330	932 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	DFNA5	O60443	496 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TJP3	O95049	919 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	KRT10	P13645	584 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TIMP2	P16035	220 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ITIH2	P19823	946 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CA4	P22748	312 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	MARCKSL1	P49006	195 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CCT8	P50990	548 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	BNIP3	Q12983	259 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	FGL2	Q14314	439 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SLC14A2	Q15849	920 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	KAZN	Q674X7	775 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ERAP2	Q6P179	960 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	HES6	Q96HZ4	224 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	VAT1	Q99536	393 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	GDF3	Q9NR23	364 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	GGT7	Q9UJ14	662 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ITM2B	Q9Y287	266 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	NEMP1	O14524	444 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	SPINT1	O43278	529 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	PIGN	O95427	931 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBM23-231	ENST00000557549	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42

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