RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 DPEP2Q9H4A9 486 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 ATP13A1Q9HD20 1204 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 PDZD2O15018 2839 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 NF1P21359 2839 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 F8P00451 2351 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 TTLL8A6PVC2 850 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 PCCBP05166 539 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 TIMP2P16035 220 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 GRNP28799 593 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 PDCLQ13371 301 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 LRRC14Q15048 493 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 TCTN3Q6NUS6 607 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 NLGN4XQ8N0W4 816 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 PATE1Q8WXA2 126 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 RTP4Q96DX8 246 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 KREMEN1Q96MU8 473 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 WDR92Q96MX6 357 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 NT5C1BQ96P26 610 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 DGKBQ9Y6T7 804 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-230ENST00000551968 A0A1B0GVL5 298 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ILVBLA1L0T0 632 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CETN3O15182 167 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 THRAP10827 490 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PRF1P14222 555 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PFKFB1P16118 471 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 HTR1BP28222 390 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SEPT6Q14141 434 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 NR1D2Q14995 579 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MYLK3Q32MK0 819 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 FAM129CQ86XR2 697 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CCDC13Q8IYE1 715 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 NRSN1Q8IZ57 195 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 AGBL5Q8NDL9 886 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CPXM1Q96SM3 734 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 APMAPQ9HDC9 416 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 NDFIP2Q9NV92 336 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TLK1Q9UKI8 766 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DNHD1Q96M86 4753 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 FGF1P05230 155 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TCN2P20062 427 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 BMP6P22004 513 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 FMO5P49326 533 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CXCR3P49682 368 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PMS1P54277 932 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 GNA12Q03113 381 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SLC20A2Q08357 652 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 NADK2Q4G0N4 442 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TMEM52BQ4KMG9 183 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 GDPD4Q6W3E5 623 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 NRROSQ86YC3 692 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DRC7Q8IY82 874 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PELI3Q8N2H9 469 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 OR2AP1Q8NGE2 309 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ARHGEF26Q96DR7 871 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ST14Q9Y5Y6 855 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 B4E171 279 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MKRN2OSH3BPM6 223 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 INSIG1O15503 277 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 HSF2BPO75031 334 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SRGAP2O75044 1071 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DNAJB5O75953 348 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ECEL1O95672 775 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DDAH2O95865 285 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 LDLRP01130 860 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TSPAN7P41732 249 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PLPP6Q8IY26 295 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 OR4D9Q8NGE8 314 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ZNF606Q8WXB4 792 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 LGR4Q9BXB1 951 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CYP4F12Q9HCS2 524 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms