RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 ZNF445P59923 1031 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 FANCCQ00597 558 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 ADIGQ0VDE8 80 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 NR1I3Q14994 352 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 DCAF10Q5QP82 559 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 PMF1Q6P1K2 205 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 LINGO4Q6UY18 593 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 ZNF677Q86XU0 584 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 CPXM2Q8N436 756 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 AADATQ8N5Z0 425 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 NEK11Q8NG66 645 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 STK32AQ8WU08 396 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 IRGQQ8WZA9 623 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 TSPY26PQ9H489 355 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 VPS13CQ709C8 3753 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 C19orf84I3L1E1 186 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 GABBR2O75899 941 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 FBXO21O94952 628 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 ZBED1O96006 694 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 HMBSP08397 361 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 C5AR1P21730 350 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 KRT9P35527 623 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SOX5P35711 763 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 RGS7P49802 495 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 DAOAP59103 153 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 KRT83P78385 493 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 PPP2R2BQ00005 443 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 EFEMP1Q12805 493 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 FZD2Q14332 565 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 TMEM110Q86TL2 294 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 TMEM135Q86UB9 458 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 DENND1CQ8IV53 801 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 PLD4Q96BZ4 506 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 NOX5Q96PH1 765 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SPAG5Q96R06 1193 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 MTG2Q9H4K7 406 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 KLF15Q9UIH9 416 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 MYO6Q9UM54 1294 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 CEP83Q9Y592 693 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SERINC4A6NH21 518 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 E7ENQ6 273 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 LMO7DNF2Z398 122 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SLC31A1O15431 190 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 SIN3BO75182 1162 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 GFPT2O94808 682 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 RECKO95980 971 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 ANXA6P08133 673 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 DLDP09622 509 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 LCP1P13796 627 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 JUNDP17535 347 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 F8A1P23610 371 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 PBX1P40424 430 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 KIR3DL1P43629 444 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 UBASH3AP57075 661 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 FOLH1Q04609 750 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 PDCLQ13371 301 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 ZNF235Q14590 738 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 CHRNA6Q15825 494 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 MPPE1Q53F39 396 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-225ENST00000551253 FIGNQ5HY92 759 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms