RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550155.5

CNOT2-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2

Gene CNOT2, Length 842 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-222	ENST00000550155	RHBDL3	P58872	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	KDM4B	O94953	1096 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CHAT	P28329	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CXCR3	P49682	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	EFR3A	Q14156	821 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	TANK	Q92844	425 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CSF3R	Q99062	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CBY3	A6NI87	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SRC	P12931	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	GPD2	P43304	727 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	BIRC2	Q13490	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	HSPB2	Q16082	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	FIG4	Q92562	907 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155		A0A0G2JPF8	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CRYAA	P02489	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	KCNA5	P22460	613 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ANOS1	P23352	680 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	MCM3	P25205	808 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	PHEX	P78562	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	CETP	P11597	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF132	P52740	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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