RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PDK1Q15118 436 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CFAP58Q5T655 872 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 MFSD7Q6UXD7 560 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SCUBE2Q9NQ36 999 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TFR2Q9UP52 801 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ITM2BQ9Y287 266 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 FPGTO14772 594 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RAD51BO15315 384 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PMLP29590 882 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 GRK6P43250 576 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SHC2P98077 582 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PPP2R5EQ16537 467 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 DAAM2Q86T65 1068 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 KLK6Q92876 244 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CDC6Q99741 560 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 KCTD5Q9NXV2 234 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 POM121BA6NF01 834 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 GIPC1O14908 333 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 DKK1O94907 266 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TGM2P21980 687 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RALGDSQ12967 914 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 INAVAQ3KP66 663 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ODF2Q5BJF6 829 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 DPPA4Q7L190 304 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 OR13H1Q8NG92 308 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC66A2RUB6 948 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNK3O14649 394 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 MMP20O60882 483 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PGLSO95336 258 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ITIH2P19823 946 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CTNNA2P26232 953 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PTPN7P35236 360 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PEX5P50542 639 aa23.41■■□□□ 1.34
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CTDSP2-203ENST00000547701 LIPIQ6XZB0 460 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 Q6ZSR6 202 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SCRN2Q96FV2 425 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SEMA3CQ99985 751 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 NT5MQ9NPB1 228 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 FZD3Q9NPG1 666 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 WASF3Q9UPY6 502 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CA5BQ9Y2D0 317 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TRIM16O95361 564 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 C6P13671 934 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 MAXP61244 160 aa23.4■■□□□ 1.34
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CTDSP2-203ENST00000547701 KIF5AQ12840 1032 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TRAF2Q12933 501 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SPC24Q8NBT2 197 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PIH1D2Q8WWB5 315 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 LGMNQ99538 433 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 KNTC1P50748 2209 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TPRP12270 2363 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PSMD11O00231 422 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 LIG3P49916 1009 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 CLDN2P57739 230 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 IHHQ14623 411 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRC73Q5JTD7 316 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 ARMC12Q5T9G4 340 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 RFX6Q8HWS3 928 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 CNTD1Q8N815 330 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 CCNYQ8ND76 341 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.39■■□□□ 1.33
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