RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 MPP6Q9NZW5 540 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 COX16Q9P0S2 106 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 PDP2Q9P2J9 529 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 STK17BO94768 372 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 UGT2B4P06133 528 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 HTR1BP28222 390 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ACADSBP45954 432 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 RAB15P59190 212 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 MC2RQ01718 297 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 SLC20A2Q08357 652 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 LRMPQ12912 555 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ADAM9Q13443 819 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ERV3-1Q14264 604 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 STILQ15468 1287 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 TMEM52BQ4KMG9 183 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 FAM129CQ86XR2 697 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 XYLT1Q86Y38 959 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 SIK2Q9H0K1 926 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 THAP9Q9H5L6 903 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ST7Q9NRC1 585 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 SERTAD1Q9UHV2 236 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 APCP25054 2843 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 NF1P21359 2839 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 PPM1DO15297 605 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 CUTAO60888 179 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 SYT1P21579 422 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 CDK17Q00537 523 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 STK38Q15208 465 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 RETSATQ6NUM9 610 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 TTC7BQ86TV6 843 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 STK32AQ8WU08 396 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 PATE1Q8WXA2 126 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 PAGE5Q96GU1 130 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 SPON2Q9BUD6 331 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 KCND3Q9UK17 655 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 POLHQ9Y253 713 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ST14Q9Y5Y6 855 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 HIVEP1P15822 2718 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ILVBLA1L0T0 632 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 CBX6O95503 412 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ECEL1O95672 775 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 GPR3P46089 330 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 KIAA1024LP59773 190 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 NME3Q13232 169 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 MAP7Q14244 749 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 AGERQ15109 404 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 MYLK3Q32MK0 819 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 TTC13Q8NBP0 860 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 OR56A4Q8NGH8 313 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 MTMR6Q9Y217 621 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 ENTPD4Q9Y227 616 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 SLC5A6Q9Y289 635 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-208ENST00000547298 KRIT1O00522 736 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 POP4O95707 220 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 FUCA1P04066 466 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PCCBP05166 539 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 OR1E1P30953 314 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 MTM1Q13496 603 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 SEMA5AQ13591 1074 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-208ENST00000547298 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms