RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546120.2

UBC-213, Transcript of ubiquitin C, human

TSL 5 BASIC

Gene UBC, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBC-213	ENST00000546120	DTL	Q9NZJ0	730 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SDHD	O14521	159 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	RAD51B	O15315	384 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ENTPD3	O75355	529 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	TIPRL	O75663	272 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	RPS6KA4	O75676	772 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CNTN5	O94779	1100 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CSPG5	O95196	566 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	NDST3	O95803	873 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CHRNA1	P02708	482 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	RBP1	P09455	135 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	THRB	P10828	461 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CD247	P20963	164 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	HTR1E	P28566	365 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	DDOST	P39656	456 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	IST1	P53990	364 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	MTMR1	Q13613	665 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	DAG1	Q14118	895 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CDK10	Q15131	360 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	DPYSL2	Q16555	572 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	TKFC	Q3LXA3	575 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	C5orf22	Q49AR2	442 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SLC51B	Q86UW2	128 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	AGAP4	Q96P64	663 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	NODAL	Q96S42	347 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CCDC32	Q9BV29	185 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	LHPP	Q9H008	270 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SIAE	Q9HAT2	523 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	C3orf18	Q9UK00	162 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	WDR27	A2RRH5	827 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	BET1	O15155	118 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CCNK	O75909	580 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	PIAS1	O75925	651 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	IL18RAP	O95256	599 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	MED26	O95402	600 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SEC24A	O95486	1093 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	TNNC2	P02585	160 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	PDGFRA	P16234	1089 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	LRPAP1	P30533	357 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ARRB2	P32121	409 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	S100A5	P33763	92 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ETV6	P41212	452 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	PTPN9	P43378	593 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SCNN1D	P51172	638 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	AIF1	P55008	147 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	SNAP25	P60880	206 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ACTR2	P61160	394 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	IFITM2	Q01629	132 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	ZNF33A	Q06730	810 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	NME3	Q13232	169 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	PRKG1	Q13976	671 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	CTF1	Q16619	201 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBC-213	ENST00000546120	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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