RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.41■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 CKMP06732 381 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 CALB2P22676 271 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 MPP1Q00013 466 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC12A1Q13621 1099 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 NEPROQ6NW34 567 aa20.41■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 TADA1Q96BN2 335 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 RILPQ96NA2 401 aa20.41■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.4■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 RTL10Q7L3V2 364 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC7BQ86TV6 843 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.4■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 CALML6Q8TD86 181 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 LATS1O95835 1130 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 C1RP00736 705 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN2P17706 415 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC8A1P32418 973 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC1A2P43004 574 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 CD151P48509 253 aa20.39■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 PGBD5Q8N414 524 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC16Q8NEE8 873 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 OR7D4Q8NG98 312 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF599Q96NL3 588 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SORT1Q99523 831 aa20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.39■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.39■□□□□ 0.85
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PACSIN3-211ENST00000539589 CRABP2P29373 138 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB10P61026 200 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF235Q14590 738 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TEAD2Q15562 447 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEH1Q9H213 219 aa20.39■□□□□ 0.85
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PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ACOT9Q9Y305 439 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 C5orf42Q9H799 3197 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 EPOPA6NHQ4 379 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM114B3SHH9 223 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN11O75508 207 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.38■□□□□ 0.85
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PACSIN3-211ENST00000539589 HOXA9P31269 272 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CHST9Q7L1S5 443 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 RIN3Q8TB24 985 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GCNAQ96QF7 691 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMA3CQ99985 751 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GDF15Q99988 308 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PDFQ9HBH1 243 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CD248Q9HCU0 757 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMCX1Q9P291 453 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CCL26Q9Y258 94 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1B0GVM2 712 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 A8MUI8 341 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINA6P08185 405 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 AVPR1AP37288 418 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GNA12Q03113 381 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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