RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537745.5

RAN-208, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, human

TSL 1 (best)

Gene RAN, Length 1,065 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAN-208	ENST00000537745	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	AREL1	O15033	823 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	DUX1	O43812	170 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	DAB1	O75553	588 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	AGFG2	O95081	481 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	PCCB	P05166	539 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	KRT7	P08729	469 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ALDH4A1	P30038	563 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	UGT1A3	P35503	534 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SULT1E1	P49888	294 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	PEX5	P50542	639 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	OR1D5	P58170	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	GNA12	Q03113	381 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	PKP1	Q13835	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	INPP5A	Q14642	412 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	NFATC4	Q14934	902 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	EFHC2	Q5JST6	749 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ATL3	Q6DD88	541 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	NETO2	Q8NC67	525 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	PDXP	Q96GD0	296 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	TAAR9	Q96RI9	348 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	APOO	Q9BUR5	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SYNC	Q9H7C4	482 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745		A1L4Q6	167 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	TOR1B	O14657	336 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	B4GAT1	O43505	415 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	RAD1	O60671	282 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	CPNE6	O95741	557 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	CD160	O95971	181 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ERBB2	P04626	1255 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	NR1D1	P20393	614 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	MPST	P25325	297 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	UQCRFS1	P47985	274 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	CXCR3	P49682	368 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	B4GALNT1	Q00973	533 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	DEUP1	Q05D60	604 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	PNOC	Q13519	176 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	MYLK3	Q32MK0	819 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ART4	Q93070	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	WDR92	Q96MX6	357 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	CATSPER2	Q96P56	530 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71	1e-7	■□□□□ 8.4
RAN-208	ENST00000537745	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ITPR2	Q14571	2701 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745		J3QL48	77 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ZNF202	O95125	648 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	GSR	P00390	522 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	TIMP2	P16035	220 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	PNLIP	P16233	465 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	KLRB1	Q12918	225 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	MEA1	Q16626	185 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	FHL5	Q5TD97	284 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RAN-208	ENST00000537745	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71

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