RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534468.1

GMDS-AS1-214, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 724 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CPNE6O95741 557 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TNFP01375 233 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 UGT2B4P06133 528 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CCL4P13236 92 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 UGT1A3P35503 534 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CD97P48960 835 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CXCR3P49682 368 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NDUFA8P51970 172 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ARF5P84085 180 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NFATC4Q14934 902 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 LRRC14Q15048 493 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 IRF4Q15306 451 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 EFHC2Q5JST6 749 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABHD17AQ96GS6 310 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PIGVQ9NUD9 493 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RRN3Q9NYV6 651 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KLQ9UEF7 1012 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SNX10Q9Y5X0 201 aa11.97□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ZW10O43264 779 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MTSS1O43312 755 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SRGAP2O75044 1071 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 F9P00740 461 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GNA15P30679 374 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SNX16P57768 344 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GNA12Q03113 381 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 LRRC63Q05C16 580 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MYLK3Q32MK0 819 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 HAPLN3Q96S86 360 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CPXM1Q96SM3 734 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 APOOQ9BUR5 198 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RDH14Q9HBH5 336 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TMEM51Q9NW97 253 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.96□□□□□ -0.49
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MED13Q9UHV7 2174 aa11.96□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 I6L893 689 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NKX2-8O15522 239 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DAB1O75553 588 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 AGFG2O95081 481 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CD160O95971 181 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GSRP00390 522 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ETFBP38117 255 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ARSDP51689 593 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 B4GALNT1Q00973 533 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SLC6A3Q01959 620 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RAD51Q06609 339 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KLRB1Q12918 225 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SEPT6Q14141 434 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 18.6
GMDS-AS1-214ENST00000534468 INPP5AQ14642 412 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 WSCD2Q2TBF2 565 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 AMZ1Q400G9 498 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RCBTB1Q8NDN9 531 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SLC45A3Q96JT2 553 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 WDR92Q96MX6 357 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NPY6RQ99463 290 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RMND1Q9NWS8 449 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.95□□□□□ -0.5
GMDS-AS1-214ENST00000534468 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms