RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 MID1O15344 667 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CPP00450 1065 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 NDUFV2P19404 249 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 DRD3P35462 400 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 GRIA1P42261 906 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CXCL12P48061 93 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CCR3P51677 355 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 OLIG2Q13516 323 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 USP30Q70CQ3 517 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB7BQ96AH8 199 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ARRDC3Q96B67 414 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SCRN2Q96FV2 425 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SERPINB12Q96P63 405 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 LYSMD1Q96S90 227 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 DYRK4Q9NR20 520 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A0J9YYE9 177 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TRBC1P01850 177 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 DNTTP04053 509 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TIMP2P16035 220 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 NFKBIAP25963 317 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TNFRSF8P28908 595 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CHRNA4P43681 627 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 METAP1P53582 386 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PLTPP55058 493 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 QPCTQ16769 361 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ARMC3Q5W041 872 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 RASSF3Q86WH2 238 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 AADATQ8N5Z0 425 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 RMDN1Q96DB5 314 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 APOL2Q9BQE5 337 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PPFIA2O75334 1257 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TUBBP07437 444 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXA6P31267 233 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 NEK3P51956 506 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TERF1P54274 439 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 EPHB1P54762 984 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 GALNT3Q14435 633 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 USP45Q70EL2 814 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 FZD4Q9ULV1 537 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TNFRSF10AO00220 468 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC7A4O43246 635 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 APBB3O95704 486 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 IGLV3-19P01714 112 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ADRB3P13945 408 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ECHS1P30084 290 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 P2RY2P41231 377 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR93Q6P2C0 686 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC7BQ86TV6 843 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 KBTBD6Q86V97 674 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PDIK1LQ8N165 341 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PAF1Q8N7H5 531 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 HACD3Q9P035 362 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 EBF1Q9UH73 591 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CAPN8A6NHC0 703 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 AREL1O15033 823 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 NPY2RP49146 381 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CNTN1Q12860 1018 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 HIF1AQ16665 826 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 AGBL4Q5VU57 503 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXL6Q8N531 539 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGB4Q8WW32 186 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 IFT81Q8WYA0 676 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 IL22Q9GZX6 179 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TRABDQ9H4I3 376 aa22.11■■□□□ 1.13
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