RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527907.5

ATG13-209, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 2

Gene ATG13, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-209ENST00000527907 AMFRQ9UKV5 643 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 CPED1A4D0V7 1026 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 DRGXA6NNA5 263 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TCEA3O75764 348 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 PIAS2O75928 621 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 LRIG2O94898 1065 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 DLDP09622 509 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 LIPCP11150 499 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 SLC6A4P31645 630 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 CD97P48960 835 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 HCAR3P49019 387 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 ADPRHP54922 357 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 STAT4Q14765 748 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 CDKN3Q16667 212 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 MPPE1Q53F39 396 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 RABGAP1LQ5R372 815 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 ARTNQ5T4W7 220 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 MEI1Q5TIA1 1274 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 FBXL22Q6P050 247 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 LRRC31Q6UY01 552 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 MAP7D3Q8IWC1 876 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 UBL4BQ8N7F7 174 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 HES6Q96HZ4 224 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 EPAS1Q99814 870 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 ZNF670Q9BS34 389 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 KLHL11Q9NVR0 708 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 SEPT10Q9P0V9 454 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 OR12D3Q9UGF7 316 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 NEU3Q9UQ49 428 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 ZFHX3Q15911 3703 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 A1L4Q6 167 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 NEMP2A6NFY4 417 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 WASH4PA8MWX3 477 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 H3BRJ5 948 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 K7ESM1 405 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 PLD2O14939 933 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 SIN3BO75182 1162 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 FTCDO95954 541 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 GOT1P17174 413 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 SLC8A1P32418 973 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 NUDT1P36639 197 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 ARL4AP40617 200 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 PEX5P50542 639 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 OXCT1P55809 520 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 POLE2P56282 527 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 RWDD2BP57060 319 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 KRT81Q14533 505 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 CA9Q16790 459 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 FHL5Q5TD97 284 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 MBLAC2Q68D91 279 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 GUSBP11Q6P575 273 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 BORAQ6PGQ7 559 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 LGI2Q8N0V4 545 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 AHI1Q8N157 1196 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 AADATQ8N5Z0 425 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 EXD1Q8NHP7 514 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-209ENST00000527907 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms