RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 MAP3K6O95382 1288 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 PRKCGP05129 697 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 C6P13671 934 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 LIG3P49916 1009 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 MAXP61244 160 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 ODF2Q5BJF6 829 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 EID2Q8N6I1 236 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 NT5MQ9NPB1 228 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 TOR4AQ9NXH8 423 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 DTLQ9NZJ0 730 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 AMACRQ9UHK6 382 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 KRT1P04264 644 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 IGFALSP35858 605 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 YPEL5P62699 121 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 FZD2Q14332 565 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 LRRC14Q15048 493 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 AGERQ15109 404 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 PNPLA1Q8N8W4 532 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 HAUS2Q9NVX0 235 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 COQ6Q9Y2Z9 468 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 HYOU1Q9Y4L1 999 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 ALG6Q9Y672 507 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-217ENST00000527644 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 SDC3O75056 442 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 DKK1O94907 266 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 NDUFA10O95299 355 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 SPINK2P20155 84 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 CES1P23141 567 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 DGKAP23743 735 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 PTK2BQ14289 1009 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC9A4Q6AI14 798 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 DPPA4Q7L190 304 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 PARGQ86W56 976 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 PLD5Q8N7P1 536 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 HDAC11Q96DB2 347 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 DNAJC28Q9NX36 388 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 APOL1O14791 398 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 PIAS2O75928 621 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 TNNT1P13805 278 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 CCNB1P14635 433 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 NFKBIAP25963 317 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.838e-6■■■■□ 19.7
TSPAN4-217ENST00000527644 SEMG2Q02383 582 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 ITKQ08881 620 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 RALGDSQ12967 914 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 WSCD2Q2TBF2 565 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC25A45Q8N413 288 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 CCNYQ8ND76 341 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 SEMA3CQ99985 751 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 PHTF1Q9UMS5 762 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 TFR2Q9UP52 801 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 GOLGA8CPA6NN73 597 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 ENC1O14682 589 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 PSTPIP1O43586 416 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 CPP00450 1065 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 CSF2P04141 144 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 THOP1P52888 689 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 TRAF2Q12933 501 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 IRF4Q15306 451 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 ALG1LQ6GMV1 187 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 LIPIQ6XZB0 460 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC13Q8IYE1 715 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 HEY1Q9Y5J3 304 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM221BA6H8Z2 402 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 NEBLO76041 1014 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 ELFN1P0C7U0 828 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 NME1P15531 152 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF542PQ5EBM4 170 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 TPRG1LQ5T0D9 272 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 ARMC12Q5T9G4 340 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 KDM7AQ6ZMT4 941 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-217ENST00000527644 RFX6Q8HWS3 928 aa26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms