RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 ITFG1Q8TB96 612 aa23.36■■□□□ 1.33
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ACER3-204ENST00000525861 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.36■■□□□ 1.33
ACER3-204ENST00000525861 BBS2Q9BXC9 721 aa23.36■■□□□ 1.33
ACER3-204ENST00000525861 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.36■■□□□ 1.33
ACER3-204ENST00000525861 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.36■■□□□ 1.33
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ACER3-204ENST00000525861 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa23.34■■□□□ 1.33
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ACER3-204ENST00000525861 STARD13Q9Y3M8 1113 aa23.34■■□□□ 1.33
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ACER3-204ENST00000525861 RAB30Q15771 203 aa23.33■■□□□ 1.33
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ACER3-204ENST00000525861 C6orf89Q6UWU4 347 aa23.33■■□□□ 1.33
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ACER3-204ENST00000525861 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.33■■□□□ 1.33
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ACER3-204ENST00000525861 HS3ST2Q9Y278 367 aa23.33■■□□□ 1.33
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ACER3-204ENST00000525861 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa23.32■■□□□ 1.32
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ACER3-204ENST00000525861 WEE1P30291 646 aa23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 TMPRSS15P98073 1019 aa23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
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ACER3-204ENST00000525861 DBN1Q16643 649 aa23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 C16orf46Q6P387 395 aa23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 MECRQ9BV79 373 aa23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 LAMA3Q16787 3333 aa23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ACER3-204ENST00000525861 C2orf81A6NN90 581 aa23.32■■□□□ 1.32
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