RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNN2Q9H2S1 579 aa0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYSLTR2Q9NS75 346 aa0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD10Q9NXR5 420 aa0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASIC3Q9UHC3 531 aa0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFU1Q9UMS0 254 aa0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DAPP1Q9UN19 280 aa0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTAGE9A4FU28 777 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM1B2RUZ4 78 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H7C423 109 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN6O43657 245 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLA2G6O60733 806 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFAND5O76080 213 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGS11O94810 467 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTAGE8P0CG41 777 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP4B1P13584 511 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYOD1P15172 320 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHN1P15882 459 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPEP1P16444 411 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRD5A1P18405 259 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S1PR1P21453 382 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFSF4P23510 183 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRNB4P30926 498 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MVDP53602 400 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ISL1P61371 349 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ECT2LQ008S8 904 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL13RA2Q14627 380 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP2R5AQ15172 486 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ESCO2Q56NI9 601 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM209BQ5JX69 171 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC22Q5TAA0 569 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP4R4Q6NUP7 873 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD54Q6NXT1 300 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AADACL2Q6P093 401 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C14orf80Q86SX3 495 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR63Q8IWG1 891 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTAGE4Q8IX94 777 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NRSN1Q8IZ57 195 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR20Q8TBZ3 569 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR60Q8WVS4 1066 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF566Q969W8 418 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA1191Q96A73 305 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MOCOSQ96EN8 888 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST6GAL2Q96JF0 529 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF354BQ96LW1 612 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00479Q96M42 142 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRDM8Q9NQV8 689 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STARD7Q9NQZ5 370 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THAP1Q9NVV9 213 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2W1Q9Y3N9 320 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN16Q9Y5I7 305 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSAG2Q9Y5P2 127 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZHX2Q9Y6X8 837 aa0.9□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0U1RQF3 1178 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEIOCA2RUB1 952 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6C68A6NDL8 312 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CBY3A6NI87 242 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDH7O60245 1069 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLK8O60259 260 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIPRLO75663 272 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAP00813 363 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSF1P09603 554 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DHRS4L1P0CG22 281 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXC8P31273 242 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RYKP34925 604 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GJC1P36383 396 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMPOP42166 694 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDK7P50613 346 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARSFP54793 590 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNC3Q14003 757 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOWAHAQ2M3V2 549 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMEL1Q495T6 779 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCAF6Q58WW2 860 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCTE1Q5JU00 501 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNT1Q5JUK3 1230 aa0.89□□□□□ -2.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIRPB2Q5JXA9 342 aa0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms