RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q8NBF4 154 aa-0.73□□□□□ -2.53
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TOMM40LQ969M1 308 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM167AQ96KS9 214 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM54Q9BYV2 358 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 PANK2Q9BZ23 570 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
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RNU6-871P-201ENST00000516122 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSCAN32Q9NX65 697 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR6C3Q9NZP0 311 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 MUTYHQ9UIF7 546 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNJ14Q9UNX9 436 aa-0.73□□□□□ -2.53
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RNU6-871P-201ENST00000516122 DHCR24Q15392 516 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa-0.74□□□□□ -2.53
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB34Q8NCN2 500 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF540Q8NDQ6 660 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDCA5Q96FF9 252 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 GAL3ST4Q96RP7 486 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R9BQ96SB3 815 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARID3AQ99856 593 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 C17orf102A2RUQ5 167 aa-0.76□□□□□ -2.53
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHGA12O60330 932 aa-0.76□□□□□ -2.53
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN1O95832 211 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 FTLP02792 175 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLA2G4BP0C869 781 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARP10275 920 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYOD1P15172 320 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 MMP8P22894 467 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 YY1P25490 414 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMPOP42166 694 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM27E3Q08E93 113 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGEF7Q14155 803 aa-0.76□□□□□ -2.53
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